La Biomicroscopia endoteliale o conta endoteliale consiste nella valutazione dello strato di cellule più profondo della cornea, l'endotelio corneale, indispensabile per la salute e la trasparenza della cornea.
La conta endoteliale serve a studiare le cellule che formano l'endotelio corneale esaminandone vitalità, densità, forma, dimensioni e variabilità. L'interpretazione dei dati raccolti permette di verificare lo stato di salute e l'efficienza di queste cellule sia in vista di interventi chirurgici, al fine di predisporre azioni protettive aggiuntive, sia al fine di prevenire e contrastare le patologie che colpiscono la cornea (poiché la malattia di questo strato di cellule fa perdere trasparenza alla cornea).